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我要观察氢键,选什么氘带溶剂?

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发表于 2008-12-29 09:59:00 | 显示全部楼层 |阅读模式

小弟合成了一个多肽化合物,想通过NMR分析分子内部的氢键关系。

$ g" ?; a% D5 E$ X

 

/ c% F! `# t, I7 ~* D, K% c( W, l

肽的性质:

6 @* n- p7 X4 j$ ?% ? h

 

$ Z I. {; w% V! D, Z5 f0 D

1.溶解性特别差,常用溶剂只溶DMSO,DMF(这两个还要加热);

. P7 k- w3 U% L

 

4 z3 {% @" A" r2 D

2.分子量约1000

1 E0 n7 x4 x& V7 w0 X

 

1 A3 |2 v; }* w3 s8 x

我老板不建议我用DMSO作溶剂(掩盖氢键关系),不知他说得对不对,请教各位大侠,我该选择什么样的溶剂?

' I2 U& W6 ~; f: X& g

 

0 s5 I* [2 b4 r2 L4 R# F

谢谢大家。

! p& P; D9 f T4 r! Q) o W% H

 

" i( m$ s7 k0 I

 

: d6 X! L" @2 }/ j8 e/ e# Q

 

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发表于 2008-12-29 16:28:58 | 显示全部楼层
以下是引用254307545在2008-12-29 9:59:00的发言:
$ K; q) d% k7 {9 B: a6 c

小弟合成了一个多肽化合物,想通过NMR分析分子内部的氢键关系。

6 J$ v. D- F3 @* R& f! p7 B

肽的性质: 

- o( a. N1 W, g( I( l( G! c' c% Y

1.溶解性特别差,常用溶剂只溶DMSO,DMF(这两个还要加热);

: ~' h$ C$ J0 r6 \4 E3 k1 n

2.分子量约1000

* a+ G$ B3 [5 Q, q# K

我老板不建议我用DMSO作溶剂(掩盖氢键关系),不知他说得对不对,请教各位大侠,我该选择什么样的溶剂? 

1 m2 H; h% a: }9 U* f

谢谢大家。

* A$ u! B1 f; |, k, p! Z

 

9 Z# |7 S4 ?6 {

既然老板不建议用DMSO作溶剂,那你就不用,他为什么立即告诉您用什么溶剂呢?不就是一句话吗!问他何为掩盖氢键关系?

6 V6 A! L6 z: j: z- ^5 a. q

 

& S* R. z S$ u# O: d

 

5 i6 i3 P0 O+ E' r/ I

 

1 K1 X$ w8 z' X) [# x1 m( j

 

; b, m1 ]8 B& W u* `8 m

 

" `% V. C8 X- A* ?$ I! }( E, p5 `* v

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 楼主| 发表于 2008-12-29 16:43:55 | 显示全部楼层
说实话,其实我老板也不太懂这个,我看的是文献上少用DMSO,一般用甲醇或吡啶,但是文献大部分是HPLC制备的,我是合成出来的,不太在乎量的多少,故问问大家对这方面有没有经验?
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发表于 2008-12-29 17:05:39 | 显示全部楼层

我没敢说你老板不懂,看来他是不太懂。

. }5 w2 l" O7 s: z1 \* R

建议:

1 B% z+ h6 V7 H" H0 O s7 z- C3 | E

样品尽可能干燥。

9 w/ }6 O7 r) [ S0 U0 @

DMSO-d6,Pyridine-d5都可以用来观察氢键,IR也可以。

- ]: `, j W5 s% i

先做个预实验,观察信号情况,浓度,温度一般都有影响,特别是水分。

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发表于 2008-12-29 17:08:25 | 显示全部楼层
研究多肽分子内氢键,实际上属于研究多肽的二级结构。。。。不仅对实验有具体要求,图谱解析也比较麻烦。。。
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 楼主| 发表于 2008-12-29 20:10:31 | 显示全部楼层
恩,楼上版主说得是啊,我已经测过CD谱了,显示是有一定的二级结构的,现在是测谱判定其结构,还望给予一定指导,从氘带试剂上来讲,DMSO是否有利于立体结构的确定?
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发表于 2009-2-1 15:21:41 | 显示全部楼层
用 DMSO和Py都可以观察到H-bond的, 如果有, 信号都还很强.
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