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【开贴】义务解答基于核磁的代谢组学相关问题

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发表于 2013-12-11 09:30:11 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 metaboss 于 2013-12-11 12:48 编辑
2 _6 K  K1 E; K8 n0 P
, g' p* x1 C# ^; Q2 ^' O3 T1.代谢组学目前的主流研究手段是NMR和色质联用两类,国内比较知名的课题组有几家,分别位于上海、大连和武汉。有兴趣的可以参见一下科学网贾伟老师的文章《代谢组学的闲谈》,http://blog.sciencenet.cn/blog-265898-299544.html
. p. b% K% Z5 {
9 _+ |4 h" p; x& K5 z8 j/ T2.代谢组学的应用非常广泛,样本对象涵盖动特、植物、微生物甚至细胞,状态可以是固态(如动物组织)、液态(如尿样血样)甚至半固态。9 m" r! i# r. _' ^* X5 D8 u

) z: ^: p9 R5 q8 Y- d3.代谢组学检测对象是分子量<1000的代谢物小分子,使用NMR能检测到包括氨基酸、单糖、二糖及部分多糖、核苷酸等,使用色质联用的方法能检测到含量更低的次生代谢产物,如植物激素和脂肪酸。通俗点来说,NMR是个网眼较大的鱼网,分辨率高,灵敏度不如色质联用,能做全局性检测,在研究目标不十分明确时能有非常好的探索功能;而色质联用的办法是个网眼很小的鱼网,只能针对特定目标进行分析,检出限可以达到pM甚至更低。; \" c$ o0 J  \% h7 `4 C0 v
9 \6 f8 }4 F) W9 g) K, D& h8 M
剩下的看大家的提问了,不知道大家关注些什么?& |; z  l# ?* z

* ~0 Z  C: i. y本人不算什么大牛,算是涉足代谢组学的小学生,但是也不怕献丑,欢迎有兴趣的提问,看到后一定及时回复。
+ n) g. x; l5 m2 ?0 R
: g$ S; J1 `5 _3 N& V) A4 t9 b9 `) z, J$ p; V
, Y2 B- s5 C5 Z. s7 F1 h7 d
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 楼主| 发表于 2014-1-23 10:15:54 | 显示全部楼层
唉呀,都没人回复的,好冷清
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发表于 2014-7-30 16:37:09 | 显示全部楼层
谢谢楼主的无私奉献。我初学代谢组,得分析一批1H-NMR谱图数据。请问有MestReNova傻瓜化的详细教程吗?包括从除去水峰区,自动调整相位和基线;以乳酸为化学位移参考峰,设此为1.33 ppm;分段积分,将积分按每张谱的总积分强度归一化,并采用中值法进行标度化后,以Excel格式将所得数据输出保存。
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 楼主| 发表于 2014-10-15 09:01:46 | 显示全部楼层
跌打丸 发表于 2014-7-30 16:37& V% I: H* A) T8 r8 ]- Q5 J9 e* P
谢谢楼主的无私奉献。我初学代谢组,得分析一批1H-NMR谱图数据。请问有MestReNova傻瓜化的详细教程吗?包 ...
6 X# x" Z# z5 f1 b% ?5 c4 h) @
我目前是使用topspin来分析的,你要的教程我没有,不好意思哈!
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发表于 2014-11-1 11:54:20 | 显示全部楼层
爱死你了,兄弟,我的问题是体液样品,各代谢产物浓度都很小,水峰抑制会使其他小信号峰更明显,但怎么操作,之前看的比较多的是presat预饱和序列,求问怎么操作啊,硬件是布鲁克400M,软件就是你的topspin2.1,可以加我qq聊,839035154
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发表于 2014-11-1 11:55:05 | 显示全部楼层
看你最近活跃啊,求帮忙,别失踪,,
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发表于 2014-11-13 23:32:57 | 显示全部楼层
代谢组学方面, 北京的军科院颜老师组, 或武汉物理所的刘老师唐老师组, 研究了多年.
# O  b" c, P+ ?) p! m9 H可以和他们直接讨论交流.
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