中国核磁共振论坛

 找回密码
 马上注册

QQ登录

只需一步,快速开始

扫一扫,访问微社区

搜索
热搜: mestrenova
查看: 10389|回复: 22

NMR数据处理方法(VNMR6.1C)

[复制链接]
发表于 2006-11-10 13:46:21 | 显示全部楼层 |阅读模式

NMR数据处理方法(VNMR6.1C)

 

一、     打开NMR软件

      在桌面上右键,选择tools-terminal,打开terminal窗口,输入vnmr打开NMR软件,此版本为vnmr6.1c,若输入vnmrj,

则打开新版本vnmrj软件

 

二、           调用图谱

点击主菜单 main menu—file—(set directory—parent-change—load—wft). 此时如果能看到你需要打开的文件,则选择该文件(注意: 每次只能选定一个文件, 选定两个以上不能调用),然后点菜单中的load,显示屏上方输入wft, 如果此时看不到你需要打开的文件,则set directory—parent—change来改变路径,直到进入正确的路径,然后点return,选择你需要打开的文件,点击菜单中的load,输入wft,此时已经能够看到图谱了。

 

三、           图谱的处理

1、  相位校正及相关处理

图谱调出后, 输入aph进行相位自动校正(也可以点击菜单中的phase手动调整相位) 输入vsadj自动调整峰高到满屏的最大峰高(也可以手动调整峰高)点击或输入dscale显示标尺点击full显示完整谱图,dg显示参数。

2、  定标

输入ds,显示图谱, 把光标移到TMS附近 输入nl 点击ref 输入0

也可定溶剂峰的化学位移值如: D2O: 4.75(H); 碳谱: CDCl3: 77(C)

3、  窗函数的应用

对于氢谱,输入lb=1,或者lb=’n’,对于碳谱,输入lb=1或者2,然后输入wf t, 目的使谱图的S/N加大,但是它是以牺牲分辨率为代价的。

4、  基线调平

对所有的峰进行积分,然后输入bc即可。

5、  查看图谱的精细结构

点击box,选定要查看的部分,点expand进行放大,点full显示整个图谱。

6、  积分

点击part intergral进行积分 输入cz对积分清零 →点击Lvl/Tlt对基线进行调平,点击reset进行分段积分→鼠标左键在所需积分峰的左右两边点击即可, 积分完毕后再输入dc调平,输入vp=12,抬高谱图的高度, 输入dpir以便显示分段积分值。

7、  化学位移的显示

图谱调出经1-2-3, 点击th调节阈值(门槛)的高度(门槛(显示黄线)以上化学位移值可以显示出来),输入dpf显示th以上各峰的化学位移值。

8、  局部放大图谱的处理

图谱调出经过步骤1-2-3, 点击box选定所要放大的范围,输入inset回车→选定位置,左键定位,右键调整大小,中键调整高度→s1(或者s2,s3)保存当前图谱,r1(或者r2,r3)调出相应的图谱,其它步骤和处理同正常的一维谱图。

9DEPT的处理

调出谱图后, 输入wft进行处理,处理过程同前,处理完毕后输入dssa同时显示DEPT的四组图谱。也可以自动处理,自动处理过程如下:点击菜单中的main menu—analyze—DEPT—full analysis(这个菜单不仅包括分析,还包括打印全套dept图谱)。

10、二维图谱的处理

调出谱图后, 输入wftwti进行窗函数处理、wft1da进行变换、wti再进行窗函数处理、wft2da进行二维谱图的变换、对于H—H 二维可以进行对称化处理, foldt命令处理即可, 如再要显示二维谱图可用dconi命令, dconi相当于一位谱图的处理命令ds。(具体处理过程从略)

 

四、           打印图谱

1一维图谱的打印

输入vp=12,这样就可以在谱图下方留出空间打印积分值。

输入pl pltext(谱图的文本文件名) pscale(谱图的标尺) pir(谱图的积分) ppf(谱图的化学位移) page(打印标志)进行打印,其中pscale为打印标尺,pir打印积分,ppf打印化学位移值, pltext打印文本参数,除了这个命令之外还可以自己编辑宏命令进行打印,本工作站编辑了一个名为zjzh的宏命令,它的内容是:vp12 pl pltext pscale pir vp=vp+90 ppf(‘top’) vp=vp-90 page。因此,在打印时,输入zjzh即可; zjzh4打印不需积分的谱图,如: 碳谱。zjzh5打印为积分竖着显示。

2、局部放大图的打印

(1)处理完一维谱图后(过程同前), 输入s1保存此图谱, 输入pl pscale pir pltext ppf 回车打印当前处理的图谱(注意此时打印机并没有执行打印命令, 其中pir, pltext, ppf为可选项)

(2)然后按照前面的方法(见二、7)处理局部放大图, 处理完毕后输入s2保存当前局部放大图, 然后输入pl pscale pir pltext ppf打印当前局部放大图(注意此时打印机并也没有执行打印命令, 其中pir, pltext, ppf为可选项)

(3)如果要继续添加其它局部放大图, 输入r1调出用s1保存过的图谱, 然后重复步骤(2)

(4)处理完局部放大图之后, 输入page执行打印命令。

3DEPT的打印

dssa显示图谱后,输入pl(‘all’)  pscale  pltext  page 进行打印。

也可以输入pldept进行打印。

4二维图谱的打印

同核二维的打印命令为plcosy(25,1.3,1),其中1表示氢谱所在的工作区,25表示打印圈数,1.3表示相邻两圈之间的间隔。

异核二维的打印命令为plhxcor(25,1.3,1,2) 其中12分别表示氢谱和碳谱所在的工作区。

五、           图谱的抓取(电子图谱的获取)

在桌面上点右键,点application-snapshot,此时已经打开snapshot软件,选择region,然后点snap进行抓图,此时光标变成十字形状,左键选取所要抓取的范围,选择完毕后,松开左键。此时便可以看到所抓取的图谱,点file-save as进行保存,保存时注意选择路径,一般为默认路径export/home/hc,然后选择所要保存文件的格式,一般选择jpeg格式,然后在下面输入所要保存的文件名,文件名请加入后缀jpeg。最后点ok进行保存,此时会提示会丢失一些数据,请点yes确认。

[此贴子已经被作者于2006-11-12 19:49:31编辑过]
回复

使用道具 举报

发表于 2006-12-7 12:33:35 | 显示全部楼层
谢谢楼主分享~~
回复 支持 反对

使用道具 举报

发表于 2006-12-18 14:35:05 | 显示全部楼层

五、           图谱的抓取(电子图谱的获取)

在桌面上点右键,点application-snapshot,此时已经打开snapshot软件,选择region,然后点snap进行抓图,此时光标变成十字形状,左键选取所要抓取的范围,选择完毕后,松开左键。此时便可以看到所抓取的图谱,点file-save as进行保存,保存时注意选择路径,一般为默认路径export/home/hc,然后选择所要保存文件的格式,一般选择jpeg格式,然后在下面输入所要保存的文件名,文件名请加入后缀jpeg。最后点ok进行保存,此时会提示会丢失一些数据,请点yes确认。

我一直都不会这个,今天学习了,谢谢

回复 支持 反对

使用道具 举报

发表于 2007-3-12 21:34:39 | 显示全部楼层
感谢,支持
回复 支持 反对

使用道具 举报

发表于 2007-9-15 10:01:44 | 显示全部楼层
很好,谢谢!
回复 支持 反对

使用道具 举报

发表于 2007-10-26 12:08:00 | 显示全部楼层
  非常感谢
回复 支持 反对

使用道具 举报

发表于 2007-11-4 09:40:34 | 显示全部楼层
谢谢斑竹,支持!!
回复 支持 反对

使用道具 举报

发表于 2008-1-28 16:14:28 | 显示全部楼层

这篇写得很详细,很到位,值得Varian谱仪用户好好学习。

学习了。

谢谢楼主分享!

回复 支持 反对

使用道具 举报

发表于 2008-2-5 20:21:15 | 显示全部楼层

有点复杂,学习中

回复 支持 反对

使用道具 举报

发表于 2008-9-22 16:58:04 | 显示全部楼层
ding
回复 支持 反对

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 马上注册

本版积分规则

Archiver|手机版|小黑屋|中国核磁共振论坛

GMT+8, 2020-9-23 10:25

Powered by Discuz! X3.4

© 2001-2017 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表